Te recomiendo que uses uno de los dos, se tratan de lo mismo y puede dar conflictos entre ellos. Yo uso el Xposed.
Lo de descargar los módulos desde la misma app no funciona desde hace ya un tiempo, no se el motivo. Tendrás que descargarlos manualmente.
En miui no funcionan todos los módulos, sólo alguno de ellos. Ni el gravity box ni el mi-tools funcionan (el desarrollador de mi-tools abandonó el proyecto y se quedo en v5).
Date una vuelta por en.miui.com que hay muchos post que hablan de qué módulos funcionan. Hay unos cuantos. Te dejo una captura de los que tengo yo instalados:

